Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRT82Q9NSB4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KRT82Q9NSB4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms