Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQY0

BIN3, Bridging integrator 3, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIN3Q9NQY0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
BIN3Q9NQY0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms