Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT5

EXOSC3, Exosome complex component RRP40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC3Q9NQT5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
EXOSC3Q9NQT5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EXOSC3Q9NQT5 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
EXOSC3Q9NQT5 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EXOSC3Q9NQT5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EXOSC3Q9NQT5 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EXOSC3Q9NQT5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EXOSC3Q9NQT5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EXOSC3Q9NQT5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
EXOSC3Q9NQT5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EXOSC3Q9NQT5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EXOSC3Q9NQT5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EXOSC3Q9NQT5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
EXOSC3Q9NQT5 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EXOSC3Q9NQT5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EXOSC3Q9NQT5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EXOSC3Q9NQT5 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
EXOSC3Q9NQT5 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EXOSC3Q9NQT5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EXOSC3Q9NQT5 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
EXOSC3Q9NQT5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
EXOSC3Q9NQT5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EXOSC3Q9NQT5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EXOSC3Q9NQT5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EXOSC3Q9NQT5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EXOSC3Q9NQT5 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EXOSC3Q9NQT5 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EXOSC3Q9NQT5 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
EXOSC3Q9NQT5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EXOSC3Q9NQT5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EXOSC3Q9NQT5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EXOSC3Q9NQT5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EXOSC3Q9NQT5 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EXOSC3Q9NQT5 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EXOSC3Q9NQT5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EXOSC3Q9NQT5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
EXOSC3Q9NQT5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
EXOSC3Q9NQT5 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EXOSC3Q9NQT5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EXOSC3Q9NQT5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
EXOSC3Q9NQT5 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms