Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPP4

NLRC4, NLR family CARD domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC4Q9NPP4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NLRC4Q9NPP4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NLRC4Q9NPP4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms