Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZCCHC17Q9NP64 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZCCHC17Q9NP64 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ZCCHC17Q9NP64 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZCCHC17Q9NP64 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZCCHC17Q9NP64 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZCCHC17Q9NP64 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZCCHC17Q9NP64 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZCCHC17Q9NP64 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZCCHC17Q9NP64 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZCCHC17Q9NP64 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZCCHC17Q9NP64 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZCCHC17Q9NP64 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZCCHC17Q9NP64 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZCCHC17Q9NP64 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZCCHC17Q9NP64 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZCCHC17Q9NP64 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZCCHC17Q9NP64 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZCCHC17Q9NP64 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZCCHC17Q9NP64 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZCCHC17Q9NP64 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZCCHC17Q9NP64 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZCCHC17Q9NP64 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZCCHC17Q9NP64 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZCCHC17Q9NP64 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZCCHC17Q9NP64 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZCCHC17Q9NP64 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZCCHC17Q9NP64 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZCCHC17Q9NP64 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZCCHC17Q9NP64 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZCCHC17Q9NP64 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZCCHC17Q9NP64 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZCCHC17Q9NP64 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ZCCHC17Q9NP64 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZCCHC17Q9NP64 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZCCHC17Q9NP64 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZCCHC17Q9NP64 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZCCHC17Q9NP64 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZCCHC17Q9NP64 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZCCHC17Q9NP64 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ZCCHC17Q9NP64 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZCCHC17Q9NP64 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZCCHC17Q9NP64 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZCCHC17Q9NP64 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms