Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCN3

TMEM8A, Post-GPI attachment to proteins factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM8AQ9HCN3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM8AQ9HCN3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM8AQ9HCN3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM8AQ9HCN3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM8AQ9HCN3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM8AQ9HCN3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM8AQ9HCN3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM8AQ9HCN3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM8AQ9HCN3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM8AQ9HCN3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM8AQ9HCN3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM8AQ9HCN3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM8AQ9HCN3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM8AQ9HCN3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM8AQ9HCN3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM8AQ9HCN3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM8AQ9HCN3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM8AQ9HCN3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM8AQ9HCN3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM8AQ9HCN3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM8AQ9HCN3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM8AQ9HCN3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM8AQ9HCN3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM8AQ9HCN3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM8AQ9HCN3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM8AQ9HCN3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM8AQ9HCN3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM8AQ9HCN3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM8AQ9HCN3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM8AQ9HCN3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM8AQ9HCN3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM8AQ9HCN3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM8AQ9HCN3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM8AQ9HCN3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM8AQ9HCN3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM8AQ9HCN3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM8AQ9HCN3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM8AQ9HCN3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM8AQ9HCN3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM8AQ9HCN3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM8AQ9HCN3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM8AQ9HCN3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM8AQ9HCN3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM8AQ9HCN3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM8AQ9HCN3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM8AQ9HCN3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM8AQ9HCN3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM8AQ9HCN3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM8AQ9HCN3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM8AQ9HCN3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM8AQ9HCN3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM8AQ9HCN3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM8AQ9HCN3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM8AQ9HCN3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM8AQ9HCN3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM8AQ9HCN3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM8AQ9HCN3 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM8AQ9HCN3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM8AQ9HCN3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM8AQ9HCN3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM8AQ9HCN3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM8AQ9HCN3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM8AQ9HCN3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM8AQ9HCN3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM8AQ9HCN3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM8AQ9HCN3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM8AQ9HCN3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM8AQ9HCN3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM8AQ9HCN3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM8AQ9HCN3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM8AQ9HCN3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM8AQ9HCN3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM8AQ9HCN3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM8AQ9HCN3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms