Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLXNA4Q9HCM2 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PLXNA4Q9HCM2 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLXNA4Q9HCM2 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLXNA4Q9HCM2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PLXNA4Q9HCM2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PLXNA4Q9HCM2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PLXNA4Q9HCM2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PLXNA4Q9HCM2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PLXNA4Q9HCM2 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PLXNA4Q9HCM2 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms