Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CENPJQ9HC77 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CENPJQ9HC77 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CENPJQ9HC77 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CENPJQ9HC77 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CENPJQ9HC77 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CENPJQ9HC77 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CENPJQ9HC77 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CENPJQ9HC77 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CENPJQ9HC77 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CENPJQ9HC77 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CENPJQ9HC77 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CENPJQ9HC77 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CENPJQ9HC77 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CENPJQ9HC77 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CENPJQ9HC77 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CENPJQ9HC77 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CENPJQ9HC77 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CENPJQ9HC77 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CENPJQ9HC77 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CENPJQ9HC77 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CENPJQ9HC77 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CENPJQ9HC77 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CENPJQ9HC77 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CENPJQ9HC77 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CENPJQ9HC77 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CENPJQ9HC77 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CENPJQ9HC77 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CENPJQ9HC77 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CENPJQ9HC77 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CENPJQ9HC77 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CENPJQ9HC77 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CENPJQ9HC77 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CENPJQ9HC77 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CENPJQ9HC77 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CENPJQ9HC77 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CENPJQ9HC77 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CENPJQ9HC77 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CENPJQ9HC77 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CENPJQ9HC77 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CENPJQ9HC77 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CENPJQ9HC77 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CENPJQ9HC77 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CENPJQ9HC77 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CENPJQ9HC77 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CENPJQ9HC77 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CENPJQ9HC77 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CENPJQ9HC77 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CENPJQ9HC77 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CENPJQ9HC77 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CENPJQ9HC77 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CENPJQ9HC77 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CENPJQ9HC77 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CENPJQ9HC77 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CENPJQ9HC77 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
CENPJQ9HC77 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CENPJQ9HC77 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CENPJQ9HC77 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CENPJQ9HC77 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CENPJQ9HC77 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CENPJQ9HC77 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CENPJQ9HC77 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CENPJQ9HC77 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CENPJQ9HC77 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CENPJQ9HC77 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CENPJQ9HC77 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CENPJQ9HC77 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CENPJQ9HC77 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CENPJQ9HC77 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CENPJQ9HC77 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CENPJQ9HC77 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CENPJQ9HC77 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CENPJQ9HC77 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CENPJQ9HC77 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CENPJQ9HC77 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CENPJQ9HC77 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CENPJQ9HC77 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CENPJQ9HC77 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CENPJQ9HC77 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CENPJQ9HC77 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CENPJQ9HC77 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CENPJQ9HC77 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CENPJQ9HC77 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
CENPJQ9HC77 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CENPJQ9HC77 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CENPJQ9HC77 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CENPJQ9HC77 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CENPJQ9HC77 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CENPJQ9HC77 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CENPJQ9HC77 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CENPJQ9HC77 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CENPJQ9HC77 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CENPJQ9HC77 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CENPJQ9HC77 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CENPJQ9HC77 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CENPJQ9HC77 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CENPJQ9HC77 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CENPJQ9HC77 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CENPJQ9HC77 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CENPJQ9HC77 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms