Protein–RNA interactions for Protein: Q9H875

PRKRIP1, PRKR-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1Q9H875 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRKRIP1Q9H875 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRKRIP1Q9H875 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRKRIP1Q9H875 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRKRIP1Q9H875 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRKRIP1Q9H875 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRKRIP1Q9H875 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRKRIP1Q9H875 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRKRIP1Q9H875 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PRKRIP1Q9H875 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRKRIP1Q9H875 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRKRIP1Q9H875 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PRKRIP1Q9H875 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRKRIP1Q9H875 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRKRIP1Q9H875 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRKRIP1Q9H875 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRKRIP1Q9H875 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRKRIP1Q9H875 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRKRIP1Q9H875 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRKRIP1Q9H875 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRKRIP1Q9H875 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PRKRIP1Q9H875 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRKRIP1Q9H875 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRKRIP1Q9H875 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRKRIP1Q9H875 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PRKRIP1Q9H875 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRKRIP1Q9H875 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRKRIP1Q9H875 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRKRIP1Q9H875 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRKRIP1Q9H875 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRKRIP1Q9H875 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRKRIP1Q9H875 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRKRIP1Q9H875 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRKRIP1Q9H875 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRKRIP1Q9H875 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRKRIP1Q9H875 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRKRIP1Q9H875 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRKRIP1Q9H875 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRKRIP1Q9H875 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRKRIP1Q9H875 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRKRIP1Q9H875 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRKRIP1Q9H875 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRKRIP1Q9H875 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRKRIP1Q9H875 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRKRIP1Q9H875 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRKRIP1Q9H875 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRKRIP1Q9H875 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRKRIP1Q9H875 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRKRIP1Q9H875 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRKRIP1Q9H875 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRKRIP1Q9H875 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRKRIP1Q9H875 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRKRIP1Q9H875 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRKRIP1Q9H875 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRKRIP1Q9H875 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRKRIP1Q9H875 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRKRIP1Q9H875 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRKRIP1Q9H875 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PRKRIP1Q9H875 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PRKRIP1Q9H875 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRKRIP1Q9H875 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRKRIP1Q9H875 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRKRIP1Q9H875 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRKRIP1Q9H875 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRKRIP1Q9H875 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRKRIP1Q9H875 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRKRIP1Q9H875 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRKRIP1Q9H875 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRKRIP1Q9H875 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRKRIP1Q9H875 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRKRIP1Q9H875 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRKRIP1Q9H875 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRKRIP1Q9H875 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRKRIP1Q9H875 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRKRIP1Q9H875 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRKRIP1Q9H875 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRKRIP1Q9H875 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRKRIP1Q9H875 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRKRIP1Q9H875 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRKRIP1Q9H875 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRKRIP1Q9H875 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRKRIP1Q9H875 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRKRIP1Q9H875 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRKRIP1Q9H875 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRKRIP1Q9H875 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRKRIP1Q9H875 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRKRIP1Q9H875 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRKRIP1Q9H875 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRKRIP1Q9H875 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRKRIP1Q9H875 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRKRIP1Q9H875 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRKRIP1Q9H875 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRKRIP1Q9H875 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRKRIP1Q9H875 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRKRIP1Q9H875 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRKRIP1Q9H875 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRKRIP1Q9H875 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRKRIP1Q9H875 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRKRIP1Q9H875 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRKRIP1Q9H875 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms