Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7C4

SYNC, Syncoilin, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCQ9H7C4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNCQ9H7C4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNCQ9H7C4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms