Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5J8

TAF1D, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1DQ9H5J8 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TAF1DQ9H5J8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TAF1DQ9H5J8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TAF1DQ9H5J8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TAF1DQ9H5J8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TAF1DQ9H5J8 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TAF1DQ9H5J8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TAF1DQ9H5J8 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TAF1DQ9H5J8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TAF1DQ9H5J8 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TAF1DQ9H5J8 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TAF1DQ9H5J8 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TAF1DQ9H5J8 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TAF1DQ9H5J8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TAF1DQ9H5J8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TAF1DQ9H5J8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TAF1DQ9H5J8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TAF1DQ9H5J8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TAF1DQ9H5J8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TAF1DQ9H5J8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TAF1DQ9H5J8 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TAF1DQ9H5J8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TAF1DQ9H5J8 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TAF1DQ9H5J8 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TAF1DQ9H5J8 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TAF1DQ9H5J8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TAF1DQ9H5J8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TAF1DQ9H5J8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TAF1DQ9H5J8 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TAF1DQ9H5J8 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TAF1DQ9H5J8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TAF1DQ9H5J8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TAF1DQ9H5J8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TAF1DQ9H5J8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TAF1DQ9H5J8 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TAF1DQ9H5J8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TAF1DQ9H5J8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TAF1DQ9H5J8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TAF1DQ9H5J8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TAF1DQ9H5J8 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TAF1DQ9H5J8 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TAF1DQ9H5J8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TAF1DQ9H5J8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TAF1DQ9H5J8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TAF1DQ9H5J8 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TAF1DQ9H5J8 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TAF1DQ9H5J8 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TAF1DQ9H5J8 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TAF1DQ9H5J8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TAF1DQ9H5J8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TAF1DQ9H5J8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TAF1DQ9H5J8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TAF1DQ9H5J8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TAF1DQ9H5J8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TAF1DQ9H5J8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TAF1DQ9H5J8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TAF1DQ9H5J8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TAF1DQ9H5J8 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TAF1DQ9H5J8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TAF1DQ9H5J8 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TAF1DQ9H5J8 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TAF1DQ9H5J8 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TAF1DQ9H5J8 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TAF1DQ9H5J8 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TAF1DQ9H5J8 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TAF1DQ9H5J8 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TAF1DQ9H5J8 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TAF1DQ9H5J8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TAF1DQ9H5J8 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TAF1DQ9H5J8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TAF1DQ9H5J8 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TAF1DQ9H5J8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TAF1DQ9H5J8 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TAF1DQ9H5J8 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TAF1DQ9H5J8 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TAF1DQ9H5J8 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TAF1DQ9H5J8 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TAF1DQ9H5J8 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TAF1DQ9H5J8 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TAF1DQ9H5J8 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TAF1DQ9H5J8 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TAF1DQ9H5J8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TAF1DQ9H5J8 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TAF1DQ9H5J8 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TAF1DQ9H5J8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TAF1DQ9H5J8 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TAF1DQ9H5J8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TAF1DQ9H5J8 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TAF1DQ9H5J8 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TAF1DQ9H5J8 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TAF1DQ9H5J8 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TAF1DQ9H5J8 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TAF1DQ9H5J8 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TAF1DQ9H5J8 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TAF1DQ9H5J8 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TAF1DQ9H5J8 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TAF1DQ9H5J8 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TAF1DQ9H5J8 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TAF1DQ9H5J8 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TAF1DQ9H5J8 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms