Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D5

NXF3, Nuclear RNA export factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF3Q9H4D5 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NXF3Q9H4D5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NXF3Q9H4D5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NXF3Q9H4D5 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NXF3Q9H4D5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NXF3Q9H4D5 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NXF3Q9H4D5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NXF3Q9H4D5 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NXF3Q9H4D5 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NXF3Q9H4D5 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NXF3Q9H4D5 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NXF3Q9H4D5 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NXF3Q9H4D5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NXF3Q9H4D5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NXF3Q9H4D5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NXF3Q9H4D5 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NXF3Q9H4D5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NXF3Q9H4D5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms