Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PDCL3Q9H2J4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms