Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C0

GAN, Gigaxonin, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GANQ9H2C0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GANQ9H2C0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms