Protein–RNA interactions for Protein: Q9H015

SLC22A4, Solute carrier family 22 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A4Q9H015 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC22A4Q9H015 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC22A4Q9H015 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC22A4Q9H015 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC22A4Q9H015 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC22A4Q9H015 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC22A4Q9H015 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC22A4Q9H015 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC22A4Q9H015 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC22A4Q9H015 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC22A4Q9H015 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC22A4Q9H015 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC22A4Q9H015 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC22A4Q9H015 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC22A4Q9H015 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC22A4Q9H015 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC22A4Q9H015 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC22A4Q9H015 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC22A4Q9H015 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC22A4Q9H015 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC22A4Q9H015 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC22A4Q9H015 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC22A4Q9H015 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC22A4Q9H015 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC22A4Q9H015 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC22A4Q9H015 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC22A4Q9H015 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC22A4Q9H015 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC22A4Q9H015 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC22A4Q9H015 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC22A4Q9H015 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC22A4Q9H015 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC22A4Q9H015 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC22A4Q9H015 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC22A4Q9H015 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC22A4Q9H015 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms