Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CTDSP1Q9GZU7 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms