Protein–RNA interactions for Protein: Q9C030

TRIM6, Tripartite motif-containing protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM6Q9C030 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM6Q9C030 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM6Q9C030 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms