Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
ROPN1BQ9BZX4 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ROPN1BQ9BZX4 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms