Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZV1

UBXN6, UBX domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN6Q9BZV1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBXN6Q9BZV1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBXN6Q9BZV1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBXN6Q9BZV1 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBXN6Q9BZV1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBXN6Q9BZV1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBXN6Q9BZV1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBXN6Q9BZV1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBXN6Q9BZV1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBXN6Q9BZV1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
UBXN6Q9BZV1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBXN6Q9BZV1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBXN6Q9BZV1 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBXN6Q9BZV1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBXN6Q9BZV1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBXN6Q9BZV1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBXN6Q9BZV1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBXN6Q9BZV1 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBXN6Q9BZV1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBXN6Q9BZV1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
UBXN6Q9BZV1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBXN6Q9BZV1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
UBXN6Q9BZV1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBXN6Q9BZV1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBXN6Q9BZV1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBXN6Q9BZV1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBXN6Q9BZV1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN6Q9BZV1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN6Q9BZV1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN6Q9BZV1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN6Q9BZV1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN6Q9BZV1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN6Q9BZV1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN6Q9BZV1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN6Q9BZV1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN6Q9BZV1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN6Q9BZV1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN6Q9BZV1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN6Q9BZV1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN6Q9BZV1 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN6Q9BZV1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN6Q9BZV1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN6Q9BZV1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN6Q9BZV1 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBXN6Q9BZV1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBXN6Q9BZV1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBXN6Q9BZV1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBXN6Q9BZV1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBXN6Q9BZV1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBXN6Q9BZV1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBXN6Q9BZV1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBXN6Q9BZV1 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBXN6Q9BZV1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
UBXN6Q9BZV1 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
UBXN6Q9BZV1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBXN6Q9BZV1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBXN6Q9BZV1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBXN6Q9BZV1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBXN6Q9BZV1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBXN6Q9BZV1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBXN6Q9BZV1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBXN6Q9BZV1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBXN6Q9BZV1 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBXN6Q9BZV1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBXN6Q9BZV1 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBXN6Q9BZV1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBXN6Q9BZV1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBXN6Q9BZV1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBXN6Q9BZV1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBXN6Q9BZV1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBXN6Q9BZV1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBXN6Q9BZV1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBXN6Q9BZV1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBXN6Q9BZV1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBXN6Q9BZV1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBXN6Q9BZV1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBXN6Q9BZV1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBXN6Q9BZV1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBXN6Q9BZV1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBXN6Q9BZV1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBXN6Q9BZV1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
UBXN6Q9BZV1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
UBXN6Q9BZV1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBXN6Q9BZV1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBXN6Q9BZV1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBXN6Q9BZV1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBXN6Q9BZV1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBXN6Q9BZV1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBXN6Q9BZV1 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBXN6Q9BZV1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBXN6Q9BZV1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBXN6Q9BZV1 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBXN6Q9BZV1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBXN6Q9BZV1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBXN6Q9BZV1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBXN6Q9BZV1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBXN6Q9BZV1 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBXN6Q9BZV1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBXN6Q9BZV1 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBXN6Q9BZV1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms