Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TRIM8Q9BZR9 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms