Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMIM3Q9BZL3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SMIM3Q9BZL3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SMIM3Q9BZL3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SMIM3Q9BZL3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SMIM3Q9BZL3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SMIM3Q9BZL3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SMIM3Q9BZL3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SMIM3Q9BZL3 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMIM3Q9BZL3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMIM3Q9BZL3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMIM3Q9BZL3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMIM3Q9BZL3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMIM3Q9BZL3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SMIM3Q9BZL3 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMIM3Q9BZL3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SMIM3Q9BZL3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMIM3Q9BZL3 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMIM3Q9BZL3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMIM3Q9BZL3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMIM3Q9BZL3 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMIM3Q9BZL3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM3Q9BZL3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM3Q9BZL3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM3Q9BZL3 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM3Q9BZL3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM3Q9BZL3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM3Q9BZL3 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM3Q9BZL3 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM3Q9BZL3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM3Q9BZL3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM3Q9BZL3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM3Q9BZL3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM3Q9BZL3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM3Q9BZL3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM3Q9BZL3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM3Q9BZL3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM3Q9BZL3 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM3Q9BZL3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM3Q9BZL3 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM3Q9BZL3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM3Q9BZL3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM3Q9BZL3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM3Q9BZL3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM3Q9BZL3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM3Q9BZL3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM3Q9BZL3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM3Q9BZL3 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM3Q9BZL3 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM3Q9BZL3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM3Q9BZL3 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM3Q9BZL3 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM3Q9BZL3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM3Q9BZL3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM3Q9BZL3 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM3Q9BZL3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM3Q9BZL3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM3Q9BZL3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM3Q9BZL3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM3Q9BZL3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM3Q9BZL3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM3Q9BZL3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM3Q9BZL3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM3Q9BZL3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM3Q9BZL3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM3Q9BZL3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM3Q9BZL3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM3Q9BZL3 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM3Q9BZL3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SMIM3Q9BZL3 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SMIM3Q9BZL3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMIM3Q9BZL3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMIM3Q9BZL3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMIM3Q9BZL3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMIM3Q9BZL3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMIM3Q9BZL3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMIM3Q9BZL3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMIM3Q9BZL3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMIM3Q9BZL3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SMIM3Q9BZL3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMIM3Q9BZL3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMIM3Q9BZL3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SMIM3Q9BZL3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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