Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZJ0

CRNKL1, Crooked neck-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 848 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRNKL1Q9BZJ0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRNKL1Q9BZJ0 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRNKL1Q9BZJ0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRNKL1Q9BZJ0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRNKL1Q9BZJ0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRNKL1Q9BZJ0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRNKL1Q9BZJ0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CRNKL1Q9BZJ0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRNKL1Q9BZJ0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CRNKL1Q9BZJ0 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRNKL1Q9BZJ0 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRNKL1Q9BZJ0 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRNKL1Q9BZJ0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRNKL1Q9BZJ0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRNKL1Q9BZJ0 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRNKL1Q9BZJ0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRNKL1Q9BZJ0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRNKL1Q9BZJ0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CRNKL1Q9BZJ0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRNKL1Q9BZJ0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRNKL1Q9BZJ0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRNKL1Q9BZJ0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRNKL1Q9BZJ0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRNKL1Q9BZJ0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRNKL1Q9BZJ0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRNKL1Q9BZJ0 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRNKL1Q9BZJ0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRNKL1Q9BZJ0 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CRNKL1Q9BZJ0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRNKL1Q9BZJ0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRNKL1Q9BZJ0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRNKL1Q9BZJ0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CRNKL1Q9BZJ0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRNKL1Q9BZJ0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRNKL1Q9BZJ0 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRNKL1Q9BZJ0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRNKL1Q9BZJ0 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CRNKL1Q9BZJ0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRNKL1Q9BZJ0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRNKL1Q9BZJ0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRNKL1Q9BZJ0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CRNKL1Q9BZJ0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CRNKL1Q9BZJ0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
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