Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CELF4Q9BZC1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CELF4Q9BZC1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CELF4Q9BZC1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CELF4Q9BZC1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CELF4Q9BZC1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CELF4Q9BZC1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CELF4Q9BZC1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CELF4Q9BZC1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CELF4Q9BZC1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CELF4Q9BZC1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CELF4Q9BZC1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CELF4Q9BZC1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CELF4Q9BZC1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CELF4Q9BZC1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CELF4Q9BZC1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CELF4Q9BZC1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CELF4Q9BZC1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CELF4Q9BZC1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CELF4Q9BZC1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CELF4Q9BZC1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CELF4Q9BZC1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CELF4Q9BZC1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CELF4Q9BZC1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CELF4Q9BZC1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CELF4Q9BZC1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CELF4Q9BZC1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CELF4Q9BZC1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CELF4Q9BZC1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CELF4Q9BZC1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CELF4Q9BZC1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CELF4Q9BZC1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CELF4Q9BZC1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CELF4Q9BZC1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CELF4Q9BZC1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CELF4Q9BZC1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CELF4Q9BZC1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CELF4Q9BZC1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CELF4Q9BZC1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CELF4Q9BZC1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CELF4Q9BZC1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CELF4Q9BZC1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CELF4Q9BZC1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CELF4Q9BZC1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CELF4Q9BZC1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CELF4Q9BZC1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CELF4Q9BZC1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CELF4Q9BZC1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CELF4Q9BZC1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CELF4Q9BZC1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CELF4Q9BZC1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CELF4Q9BZC1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CELF4Q9BZC1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CELF4Q9BZC1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CELF4Q9BZC1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CELF4Q9BZC1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CELF4Q9BZC1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CELF4Q9BZC1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CELF4Q9BZC1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CELF4Q9BZC1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CELF4Q9BZC1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CELF4Q9BZC1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CELF4Q9BZC1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CELF4Q9BZC1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CELF4Q9BZC1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CELF4Q9BZC1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CELF4Q9BZC1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CELF4Q9BZC1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CELF4Q9BZC1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CELF4Q9BZC1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CELF4Q9BZC1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CELF4Q9BZC1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CELF4Q9BZC1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CELF4Q9BZC1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CELF4Q9BZC1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CELF4Q9BZC1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CELF4Q9BZC1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CELF4Q9BZC1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CELF4Q9BZC1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CELF4Q9BZC1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CELF4Q9BZC1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CELF4Q9BZC1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CELF4Q9BZC1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CELF4Q9BZC1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CELF4Q9BZC1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CELF4Q9BZC1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CELF4Q9BZC1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CELF4Q9BZC1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CELF4Q9BZC1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CELF4Q9BZC1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CELF4Q9BZC1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CELF4Q9BZC1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CELF4Q9BZC1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CELF4Q9BZC1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms