Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
YTHDF1Q9BYJ9 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
YTHDF1Q9BYJ9 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms