Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS0

COL25A1, Collagen alpha-1(XXV) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL25A1Q9BXS0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL25A1Q9BXS0 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL25A1Q9BXS0 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
COL25A1Q9BXS0 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
COL25A1Q9BXS0 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL25A1Q9BXS0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL25A1Q9BXS0 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL25A1Q9BXS0 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL25A1Q9BXS0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL25A1Q9BXS0 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL25A1Q9BXS0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COL25A1Q9BXS0 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL25A1Q9BXS0 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL25A1Q9BXS0 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL25A1Q9BXS0 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL25A1Q9BXS0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
COL25A1Q9BXS0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL25A1Q9BXS0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COL25A1Q9BXS0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL25A1Q9BXS0 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL25A1Q9BXS0 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL25A1Q9BXS0 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
COL25A1Q9BXS0 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL25A1Q9BXS0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL25A1Q9BXS0 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL25A1Q9BXS0 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL25A1Q9BXS0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL25A1Q9BXS0 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL25A1Q9BXS0 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COL25A1Q9BXS0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL25A1Q9BXS0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL25A1Q9BXS0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL25A1Q9BXS0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL25A1Q9BXS0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL25A1Q9BXS0 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
COL25A1Q9BXS0 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL25A1Q9BXS0 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL25A1Q9BXS0 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL25A1Q9BXS0 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL25A1Q9BXS0 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL25A1Q9BXS0 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
COL25A1Q9BXS0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL25A1Q9BXS0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COL25A1Q9BXS0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL25A1Q9BXS0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL25A1Q9BXS0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL25A1Q9BXS0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL25A1Q9BXS0 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL25A1Q9BXS0 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL25A1Q9BXS0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL25A1Q9BXS0 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL25A1Q9BXS0 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL25A1Q9BXS0 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL25A1Q9BXS0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL25A1Q9BXS0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL25A1Q9BXS0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COL25A1Q9BXS0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COL25A1Q9BXS0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms