Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL8

CDCA4, Cell division cycle-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA4Q9BXL8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDCA4Q9BXL8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDCA4Q9BXL8 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms