Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VN1R3Q9BXE9 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VN1R3Q9BXE9 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms