Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
C9orf16Q9BUW7 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms