Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSV6

TSEN34, tRNA-splicing endonuclease subunit Sen34, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSEN34Q9BSV6 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TSEN34Q9BSV6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TSEN34Q9BSV6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TSEN34Q9BSV6 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TSEN34Q9BSV6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSEN34Q9BSV6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSEN34Q9BSV6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSEN34Q9BSV6 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSEN34Q9BSV6 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSEN34Q9BSV6 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSEN34Q9BSV6 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSEN34Q9BSV6 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSEN34Q9BSV6 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSEN34Q9BSV6 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSEN34Q9BSV6 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TSEN34Q9BSV6 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSEN34Q9BSV6 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSEN34Q9BSV6 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSEN34Q9BSV6 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSEN34Q9BSV6 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TSEN34Q9BSV6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSEN34Q9BSV6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSEN34Q9BSV6 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSEN34Q9BSV6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSEN34Q9BSV6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSEN34Q9BSV6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSEN34Q9BSV6 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSEN34Q9BSV6 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSEN34Q9BSV6 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TSEN34Q9BSV6 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TSEN34Q9BSV6 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSEN34Q9BSV6 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSEN34Q9BSV6 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSEN34Q9BSV6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSEN34Q9BSV6 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TSEN34Q9BSV6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TSEN34Q9BSV6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSEN34Q9BSV6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSEN34Q9BSV6 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSEN34Q9BSV6 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSEN34Q9BSV6 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSEN34Q9BSV6 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TSEN34Q9BSV6 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSEN34Q9BSV6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSEN34Q9BSV6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSEN34Q9BSV6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSEN34Q9BSV6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSEN34Q9BSV6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSEN34Q9BSV6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSEN34Q9BSV6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSEN34Q9BSV6 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSEN34Q9BSV6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TSEN34Q9BSV6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSEN34Q9BSV6 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSEN34Q9BSV6 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TSEN34Q9BSV6 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms