Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC39A3Q9BRY0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC39A3Q9BRY0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC39A3Q9BRY0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC39A3Q9BRY0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC39A3Q9BRY0 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC39A3Q9BRY0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC39A3Q9BRY0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC39A3Q9BRY0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC39A3Q9BRY0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC39A3Q9BRY0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC39A3Q9BRY0 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC39A3Q9BRY0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC39A3Q9BRY0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC39A3Q9BRY0 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC39A3Q9BRY0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC39A3Q9BRY0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC39A3Q9BRY0 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC39A3Q9BRY0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC39A3Q9BRY0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC39A3Q9BRY0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC39A3Q9BRY0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC39A3Q9BRY0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC39A3Q9BRY0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC39A3Q9BRY0 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC39A3Q9BRY0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC39A3Q9BRY0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC39A3Q9BRY0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC39A3Q9BRY0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC39A3Q9BRY0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC39A3Q9BRY0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC39A3Q9BRY0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC39A3Q9BRY0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC39A3Q9BRY0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC39A3Q9BRY0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC39A3Q9BRY0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC39A3Q9BRY0 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC39A3Q9BRY0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC39A3Q9BRY0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC39A3Q9BRY0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC39A3Q9BRY0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC39A3Q9BRY0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC39A3Q9BRY0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC39A3Q9BRY0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC39A3Q9BRY0 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC39A3Q9BRY0 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC39A3Q9BRY0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC39A3Q9BRY0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC39A3Q9BRY0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC39A3Q9BRY0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC39A3Q9BRY0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC39A3Q9BRY0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC39A3Q9BRY0 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC39A3Q9BRY0 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC39A3Q9BRY0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC39A3Q9BRY0 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SLC39A3Q9BRY0 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SLC39A3Q9BRY0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC39A3Q9BRY0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC39A3Q9BRY0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC39A3Q9BRY0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC39A3Q9BRY0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC39A3Q9BRY0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC39A3Q9BRY0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC39A3Q9BRY0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC39A3Q9BRY0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC39A3Q9BRY0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC39A3Q9BRY0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC39A3Q9BRY0 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC39A3Q9BRY0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC39A3Q9BRY0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC39A3Q9BRY0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC39A3Q9BRY0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC39A3Q9BRY0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC39A3Q9BRY0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC39A3Q9BRY0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC39A3Q9BRY0 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC39A3Q9BRY0 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC39A3Q9BRY0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC39A3Q9BRY0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC39A3Q9BRY0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC39A3Q9BRY0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC39A3Q9BRY0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC39A3Q9BRY0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC39A3Q9BRY0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC39A3Q9BRY0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC39A3Q9BRY0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC39A3Q9BRY0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC39A3Q9BRY0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC39A3Q9BRY0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC39A3Q9BRY0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC39A3Q9BRY0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC39A3Q9BRY0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC39A3Q9BRY0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC39A3Q9BRY0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC39A3Q9BRY0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC39A3Q9BRY0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC39A3Q9BRY0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC39A3Q9BRY0 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC39A3Q9BRY0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms