Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SDF4Q9BRK5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SDF4Q9BRK5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SDF4Q9BRK5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SDF4Q9BRK5 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SDF4Q9BRK5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SDF4Q9BRK5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SDF4Q9BRK5 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SDF4Q9BRK5 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SDF4Q9BRK5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms