Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ04

RBM4B, RNA-binding protein 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM4BQ9BQ04 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RBM4BQ9BQ04 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBM4BQ9BQ04 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms