Protein–RNA interactions for Protein: Q99967

CITED2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2Q99967 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CITED2Q99967 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CITED2Q99967 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms