Protein–RNA interactions for Protein: Q99638

RAD9A, Cell cycle checkpoint control protein RAD9A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9AQ99638 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD9AQ99638 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD9AQ99638 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms