Protein–RNA interactions for Protein: Q99612

KLF6, Krueppel-like factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF6Q99612 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLF6Q99612 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLF6Q99612 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLF6Q99612 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLF6Q99612 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
KLF6Q99612 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLF6Q99612 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLF6Q99612 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLF6Q99612 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLF6Q99612 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLF6Q99612 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLF6Q99612 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLF6Q99612 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLF6Q99612 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLF6Q99612 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLF6Q99612 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KLF6Q99612 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KLF6Q99612 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KLF6Q99612 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLF6Q99612 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLF6Q99612 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLF6Q99612 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLF6Q99612 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLF6Q99612 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLF6Q99612 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLF6Q99612 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLF6Q99612 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLF6Q99612 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLF6Q99612 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLF6Q99612 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLF6Q99612 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLF6Q99612 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLF6Q99612 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLF6Q99612 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLF6Q99612 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLF6Q99612 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KLF6Q99612 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLF6Q99612 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLF6Q99612 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLF6Q99612 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLF6Q99612 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLF6Q99612 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLF6Q99612 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KLF6Q99612 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLF6Q99612 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLF6Q99612 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLF6Q99612 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLF6Q99612 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLF6Q99612 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLF6Q99612 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLF6Q99612 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLF6Q99612 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLF6Q99612 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLF6Q99612 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLF6Q99612 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLF6Q99612 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLF6Q99612 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLF6Q99612 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KLF6Q99612 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLF6Q99612 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLF6Q99612 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLF6Q99612 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLF6Q99612 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLF6Q99612 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KLF6Q99612 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLF6Q99612 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLF6Q99612 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLF6Q99612 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLF6Q99612 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLF6Q99612 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLF6Q99612 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLF6Q99612 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KLF6Q99612 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLF6Q99612 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLF6Q99612 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLF6Q99612 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLF6Q99612 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLF6Q99612 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLF6Q99612 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KLF6Q99612 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLF6Q99612 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLF6Q99612 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLF6Q99612 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLF6Q99612 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLF6Q99612 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLF6Q99612 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLF6Q99612 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLF6Q99612 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLF6Q99612 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLF6Q99612 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLF6Q99612 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
KLF6Q99612 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLF6Q99612 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLF6Q99612 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLF6Q99612 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLF6Q99612 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
KLF6Q99612 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLF6Q99612 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLF6Q99612 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLF6Q99612 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms