Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PIK3R4Q99570 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PIK3R4Q99570 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PIK3R4Q99570 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PIK3R4Q99570 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PIK3R4Q99570 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PIK3R4Q99570 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PIK3R4Q99570 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PIK3R4Q99570 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PIK3R4Q99570 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PIK3R4Q99570 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PIK3R4Q99570 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PIK3R4Q99570 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PIK3R4Q99570 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PIK3R4Q99570 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PIK3R4Q99570 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PIK3R4Q99570 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PIK3R4Q99570 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PIK3R4Q99570 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PIK3R4Q99570 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PIK3R4Q99570 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PIK3R4Q99570 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
PIK3R4Q99570 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PIK3R4Q99570 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
PIK3R4Q99570 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PIK3R4Q99570 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PIK3R4Q99570 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PIK3R4Q99570 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PIK3R4Q99570 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PIK3R4Q99570 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PIK3R4Q99570 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PIK3R4Q99570 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PIK3R4Q99570 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PIK3R4Q99570 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PIK3R4Q99570 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
PIK3R4Q99570 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PIK3R4Q99570 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PIK3R4Q99570 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
PIK3R4Q99570 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PIK3R4Q99570 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PIK3R4Q99570 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PIK3R4Q99570 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PIK3R4Q99570 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PIK3R4Q99570 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PIK3R4Q99570 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PIK3R4Q99570 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PIK3R4Q99570 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PIK3R4Q99570 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PIK3R4Q99570 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PIK3R4Q99570 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PIK3R4Q99570 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PIK3R4Q99570 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PIK3R4Q99570 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PIK3R4Q99570 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PIK3R4Q99570 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PIK3R4Q99570 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PIK3R4Q99570 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PIK3R4Q99570 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PIK3R4Q99570 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PIK3R4Q99570 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PIK3R4Q99570 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PIK3R4Q99570 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PIK3R4Q99570 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PIK3R4Q99570 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PIK3R4Q99570 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PIK3R4Q99570 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PIK3R4Q99570 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PIK3R4Q99570 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PIK3R4Q99570 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PIK3R4Q99570 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PIK3R4Q99570 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PIK3R4Q99570 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PIK3R4Q99570 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PIK3R4Q99570 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PIK3R4Q99570 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PIK3R4Q99570 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PIK3R4Q99570 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PIK3R4Q99570 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PIK3R4Q99570 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PIK3R4Q99570 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PIK3R4Q99570 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PIK3R4Q99570 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PIK3R4Q99570 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PIK3R4Q99570 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
PIK3R4Q99570 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PIK3R4Q99570 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PIK3R4Q99570 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PIK3R4Q99570 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PIK3R4Q99570 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PIK3R4Q99570 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PIK3R4Q99570 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PIK3R4Q99570 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PIK3R4Q99570 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PIK3R4Q99570 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PIK3R4Q99570 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PIK3R4Q99570 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PIK3R4Q99570 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PIK3R4Q99570 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
PIK3R4Q99570 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PIK3R4Q99570 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms