Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUP88Q99567 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUP88Q99567 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUP88Q99567 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUP88Q99567 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUP88Q99567 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUP88Q99567 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUP88Q99567 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUP88Q99567 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUP88Q99567 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUP88Q99567 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUP88Q99567 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUP88Q99567 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUP88Q99567 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUP88Q99567 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUP88Q99567 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUP88Q99567 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUP88Q99567 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUP88Q99567 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUP88Q99567 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NUP88Q99567 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NUP88Q99567 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUP88Q99567 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUP88Q99567 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUP88Q99567 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUP88Q99567 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUP88Q99567 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NUP88Q99567 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NUP88Q99567 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUP88Q99567 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUP88Q99567 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUP88Q99567 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUP88Q99567 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUP88Q99567 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUP88Q99567 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUP88Q99567 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUP88Q99567 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUP88Q99567 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NUP88Q99567 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NUP88Q99567 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUP88Q99567 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUP88Q99567 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NUP88Q99567 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUP88Q99567 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUP88Q99567 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUP88Q99567 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUP88Q99567 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUP88Q99567 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUP88Q99567 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP88Q99567 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP88Q99567 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP88Q99567 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP88Q99567 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP88Q99567 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP88Q99567 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP88Q99567 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP88Q99567 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP88Q99567 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP88Q99567 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP88Q99567 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP88Q99567 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP88Q99567 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP88Q99567 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP88Q99567 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP88Q99567 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP88Q99567 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUP88Q99567 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP88Q99567 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP88Q99567 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP88Q99567 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP88Q99567 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP88Q99567 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP88Q99567 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP88Q99567 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP88Q99567 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUP88Q99567 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUP88Q99567 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUP88Q99567 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUP88Q99567 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUP88Q99567 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUP88Q99567 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUP88Q99567 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUP88Q99567 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUP88Q99567 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUP88Q99567 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUP88Q99567 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUP88Q99567 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUP88Q99567 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUP88Q99567 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUP88Q99567 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUP88Q99567 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUP88Q99567 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUP88Q99567 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NUP88Q99567 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUP88Q99567 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUP88Q99567 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUP88Q99567 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUP88Q99567 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUP88Q99567 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUP88Q99567 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms