Protein–RNA interactions for Protein: Q99457

NAP1L3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L3Q99457 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NAP1L3Q99457 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NAP1L3Q99457 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NAP1L3Q99457 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NAP1L3Q99457 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NAP1L3Q99457 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NAP1L3Q99457 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NAP1L3Q99457 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NAP1L3Q99457 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NAP1L3Q99457 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NAP1L3Q99457 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NAP1L3Q99457 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NAP1L3Q99457 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NAP1L3Q99457 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NAP1L3Q99457 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NAP1L3Q99457 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NAP1L3Q99457 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NAP1L3Q99457 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NAP1L3Q99457 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NAP1L3Q99457 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NAP1L3Q99457 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NAP1L3Q99457 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NAP1L3Q99457 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NAP1L3Q99457 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NAP1L3Q99457 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NAP1L3Q99457 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NAP1L3Q99457 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NAP1L3Q99457 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NAP1L3Q99457 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NAP1L3Q99457 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NAP1L3Q99457 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NAP1L3Q99457 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NAP1L3Q99457 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NAP1L3Q99457 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NAP1L3Q99457 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NAP1L3Q99457 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NAP1L3Q99457 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NAP1L3Q99457 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NAP1L3Q99457 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NAP1L3Q99457 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NAP1L3Q99457 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NAP1L3Q99457 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NAP1L3Q99457 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NAP1L3Q99457 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NAP1L3Q99457 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NAP1L3Q99457 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NAP1L3Q99457 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NAP1L3Q99457 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NAP1L3Q99457 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NAP1L3Q99457 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NAP1L3Q99457 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NAP1L3Q99457 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NAP1L3Q99457 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NAP1L3Q99457 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NAP1L3Q99457 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NAP1L3Q99457 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NAP1L3Q99457 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NAP1L3Q99457 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NAP1L3Q99457 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NAP1L3Q99457 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NAP1L3Q99457 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NAP1L3Q99457 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NAP1L3Q99457 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NAP1L3Q99457 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NAP1L3Q99457 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
NAP1L3Q99457 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NAP1L3Q99457 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms