Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CRBNQ96SW2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CRBNQ96SW2 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CRBNQ96SW2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CRBNQ96SW2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CRBNQ96SW2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CRBNQ96SW2 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CRBNQ96SW2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CRBNQ96SW2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CRBNQ96SW2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CRBNQ96SW2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CRBNQ96SW2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CRBNQ96SW2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CRBNQ96SW2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CRBNQ96SW2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CRBNQ96SW2 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CRBNQ96SW2 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CRBNQ96SW2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CRBNQ96SW2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CRBNQ96SW2 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CRBNQ96SW2 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CRBNQ96SW2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CRBNQ96SW2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CRBNQ96SW2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CRBNQ96SW2 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CRBNQ96SW2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CRBNQ96SW2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CRBNQ96SW2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CRBNQ96SW2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CRBNQ96SW2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CRBNQ96SW2 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CRBNQ96SW2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CRBNQ96SW2 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CRBNQ96SW2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CRBNQ96SW2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CRBNQ96SW2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CRBNQ96SW2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CRBNQ96SW2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CRBNQ96SW2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CRBNQ96SW2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CRBNQ96SW2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CRBNQ96SW2 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CRBNQ96SW2 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CRBNQ96SW2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CRBNQ96SW2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CRBNQ96SW2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CRBNQ96SW2 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CRBNQ96SW2 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CRBNQ96SW2 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CRBNQ96SW2 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CRBNQ96SW2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CRBNQ96SW2 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CRBNQ96SW2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CRBNQ96SW2 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CRBNQ96SW2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CRBNQ96SW2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CRBNQ96SW2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CRBNQ96SW2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CRBNQ96SW2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CRBNQ96SW2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CRBNQ96SW2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CRBNQ96SW2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CRBNQ96SW2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CRBNQ96SW2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CRBNQ96SW2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CRBNQ96SW2 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CRBNQ96SW2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CRBNQ96SW2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CRBNQ96SW2 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CRBNQ96SW2 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CRBNQ96SW2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CRBNQ96SW2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CRBNQ96SW2 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CRBNQ96SW2 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CRBNQ96SW2 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CRBNQ96SW2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CRBNQ96SW2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CRBNQ96SW2 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CRBNQ96SW2 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CRBNQ96SW2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CRBNQ96SW2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CRBNQ96SW2 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CRBNQ96SW2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CRBNQ96SW2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CRBNQ96SW2 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CRBNQ96SW2 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CRBNQ96SW2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CRBNQ96SW2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CRBNQ96SW2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CRBNQ96SW2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CRBNQ96SW2 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CRBNQ96SW2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CRBNQ96SW2 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CRBNQ96SW2 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CRBNQ96SW2 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CRBNQ96SW2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CRBNQ96SW2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CRBNQ96SW2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CRBNQ96SW2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CRBNQ96SW2 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms