Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TSPAN18Q96SJ8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TSPAN18Q96SJ8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms