Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CRAMP1Q96RY5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CRAMP1Q96RY5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CRAMP1Q96RY5 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CRAMP1Q96RY5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CRAMP1Q96RY5 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CRAMP1Q96RY5 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CRAMP1Q96RY5 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CRAMP1Q96RY5 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRAMP1Q96RY5 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRAMP1Q96RY5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRAMP1Q96RY5 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRAMP1Q96RY5 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRAMP1Q96RY5 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CRAMP1Q96RY5 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRAMP1Q96RY5 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRAMP1Q96RY5 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRAMP1Q96RY5 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRAMP1Q96RY5 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRAMP1Q96RY5 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRAMP1Q96RY5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRAMP1Q96RY5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRAMP1Q96RY5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRAMP1Q96RY5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CRAMP1Q96RY5 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CRAMP1Q96RY5 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CRAMP1Q96RY5 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CRAMP1Q96RY5 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CRAMP1Q96RY5 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CRAMP1Q96RY5 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CRAMP1Q96RY5 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CRAMP1Q96RY5 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CRAMP1Q96RY5 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CRAMP1Q96RY5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CRAMP1Q96RY5 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CRAMP1Q96RY5 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CRAMP1Q96RY5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CRAMP1Q96RY5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRAMP1Q96RY5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRAMP1Q96RY5 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRAMP1Q96RY5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRAMP1Q96RY5 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRAMP1Q96RY5 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRAMP1Q96RY5 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRAMP1Q96RY5 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRAMP1Q96RY5 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRAMP1Q96RY5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRAMP1Q96RY5 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRAMP1Q96RY5 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CRAMP1Q96RY5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CRAMP1Q96RY5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CRAMP1Q96RY5 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CRAMP1Q96RY5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CRAMP1Q96RY5 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CRAMP1Q96RY5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CRAMP1Q96RY5 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CRAMP1Q96RY5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CRAMP1Q96RY5 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CRAMP1Q96RY5 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CRAMP1Q96RY5 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CRAMP1Q96RY5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CRAMP1Q96RY5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CRAMP1Q96RY5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CRAMP1Q96RY5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CRAMP1Q96RY5 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CRAMP1Q96RY5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CRAMP1Q96RY5 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CRAMP1Q96RY5 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CRAMP1Q96RY5 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CRAMP1Q96RY5 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CRAMP1Q96RY5 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CRAMP1Q96RY5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CRAMP1Q96RY5 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CRAMP1Q96RY5 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CRAMP1Q96RY5 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CRAMP1Q96RY5 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CRAMP1Q96RY5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CRAMP1Q96RY5 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CRAMP1Q96RY5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CRAMP1Q96RY5 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms