Protein–RNA interactions for Protein: Q96RL1

UIMC1, BRCA1-A complex subunit RAP80, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UIMC1Q96RL1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
UIMC1Q96RL1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UIMC1Q96RL1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UIMC1Q96RL1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UIMC1Q96RL1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UIMC1Q96RL1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UIMC1Q96RL1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UIMC1Q96RL1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UIMC1Q96RL1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UIMC1Q96RL1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UIMC1Q96RL1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UIMC1Q96RL1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
UIMC1Q96RL1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UIMC1Q96RL1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UIMC1Q96RL1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UIMC1Q96RL1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UIMC1Q96RL1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UIMC1Q96RL1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UIMC1Q96RL1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UIMC1Q96RL1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UIMC1Q96RL1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UIMC1Q96RL1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UIMC1Q96RL1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
UIMC1Q96RL1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UIMC1Q96RL1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UIMC1Q96RL1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UIMC1Q96RL1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
UIMC1Q96RL1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UIMC1Q96RL1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UIMC1Q96RL1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UIMC1Q96RL1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UIMC1Q96RL1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UIMC1Q96RL1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UIMC1Q96RL1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UIMC1Q96RL1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UIMC1Q96RL1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UIMC1Q96RL1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UIMC1Q96RL1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UIMC1Q96RL1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UIMC1Q96RL1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
UIMC1Q96RL1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UIMC1Q96RL1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UIMC1Q96RL1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UIMC1Q96RL1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UIMC1Q96RL1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UIMC1Q96RL1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UIMC1Q96RL1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UIMC1Q96RL1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UIMC1Q96RL1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UIMC1Q96RL1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UIMC1Q96RL1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms