Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CICQ96RK0 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CICQ96RK0 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CICQ96RK0 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CICQ96RK0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CICQ96RK0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CICQ96RK0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CICQ96RK0 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CICQ96RK0 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CICQ96RK0 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CICQ96RK0 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CICQ96RK0 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CICQ96RK0 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CICQ96RK0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CICQ96RK0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CICQ96RK0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CICQ96RK0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CICQ96RK0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CICQ96RK0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CICQ96RK0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CICQ96RK0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CICQ96RK0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CICQ96RK0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CICQ96RK0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CICQ96RK0 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CICQ96RK0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CICQ96RK0 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CICQ96RK0 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CICQ96RK0 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CICQ96RK0 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CICQ96RK0 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CICQ96RK0 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CICQ96RK0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CICQ96RK0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CICQ96RK0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CICQ96RK0 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CICQ96RK0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CICQ96RK0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CICQ96RK0 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CICQ96RK0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CICQ96RK0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CICQ96RK0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CICQ96RK0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CICQ96RK0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CICQ96RK0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CICQ96RK0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CICQ96RK0 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CICQ96RK0 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CICQ96RK0 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CICQ96RK0 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CICQ96RK0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CICQ96RK0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CICQ96RK0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CICQ96RK0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CICQ96RK0 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CICQ96RK0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CICQ96RK0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CICQ96RK0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CICQ96RK0 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CICQ96RK0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CICQ96RK0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CICQ96RK0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CICQ96RK0 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CICQ96RK0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CICQ96RK0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CICQ96RK0 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CICQ96RK0 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CICQ96RK0 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CICQ96RK0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CICQ96RK0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CICQ96RK0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CICQ96RK0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CICQ96RK0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CICQ96RK0 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CICQ96RK0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CICQ96RK0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CICQ96RK0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CICQ96RK0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CICQ96RK0 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CICQ96RK0 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CICQ96RK0 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CICQ96RK0 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CICQ96RK0 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CICQ96RK0 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CICQ96RK0 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CICQ96RK0 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms