Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARXQ96QS3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARXQ96QS3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms