Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GCNAQ96QF7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GCNAQ96QF7 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms