Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GBP4Q96PP9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GBP4Q96PP9 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GBP4Q96PP9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GBP4Q96PP9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GBP4Q96PP9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GBP4Q96PP9 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GBP4Q96PP9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GBP4Q96PP9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GBP4Q96PP9 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GBP4Q96PP9 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GBP4Q96PP9 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GBP4Q96PP9 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GBP4Q96PP9 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GBP4Q96PP9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GBP4Q96PP9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GBP4Q96PP9 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GBP4Q96PP9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GBP4Q96PP9 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GBP4Q96PP9 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GBP4Q96PP9 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GBP4Q96PP9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GBP4Q96PP9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GBP4Q96PP9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GBP4Q96PP9 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GBP4Q96PP9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GBP4Q96PP9 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GBP4Q96PP9 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GBP4Q96PP9 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GBP4Q96PP9 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GBP4Q96PP9 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GBP4Q96PP9 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GBP4Q96PP9 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GBP4Q96PP9 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GBP4Q96PP9 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GBP4Q96PP9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GBP4Q96PP9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GBP4Q96PP9 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GBP4Q96PP9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GBP4Q96PP9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GBP4Q96PP9 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GBP4Q96PP9 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GBP4Q96PP9 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GBP4Q96PP9 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GBP4Q96PP9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GBP4Q96PP9 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GBP4Q96PP9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GBP4Q96PP9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GBP4Q96PP9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GBP4Q96PP9 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GBP4Q96PP9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GBP4Q96PP9 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GBP4Q96PP9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GBP4Q96PP9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GBP4Q96PP9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GBP4Q96PP9 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GBP4Q96PP9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GBP4Q96PP9 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GBP4Q96PP9 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GBP4Q96PP9 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GBP4Q96PP9 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GBP4Q96PP9 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GBP4Q96PP9 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GBP4Q96PP9 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GBP4Q96PP9 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GBP4Q96PP9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GBP4Q96PP9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GBP4Q96PP9 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GBP4Q96PP9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GBP4Q96PP9 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GBP4Q96PP9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GBP4Q96PP9 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GBP4Q96PP9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GBP4Q96PP9 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GBP4Q96PP9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GBP4Q96PP9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GBP4Q96PP9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GBP4Q96PP9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GBP4Q96PP9 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GBP4Q96PP9 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GBP4Q96PP9 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GBP4Q96PP9 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GBP4Q96PP9 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GBP4Q96PP9 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GBP4Q96PP9 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GBP4Q96PP9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GBP4Q96PP9 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBP4Q96PP9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBP4Q96PP9 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBP4Q96PP9 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBP4Q96PP9 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBP4Q96PP9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBP4Q96PP9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBP4Q96PP9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBP4Q96PP9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBP4Q96PP9 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBP4Q96PP9 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBP4Q96PP9 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBP4Q96PP9 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GBP4Q96PP9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms