Protein–RNA interactions for Protein: Q96P16

RPRD1A, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1AQ96P16 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPRD1AQ96P16 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPRD1AQ96P16 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPRD1AQ96P16 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPRD1AQ96P16 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPRD1AQ96P16 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPRD1AQ96P16 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPRD1AQ96P16 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPRD1AQ96P16 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPRD1AQ96P16 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RPRD1AQ96P16 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPRD1AQ96P16 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms