Protein–RNA interactions for Protein: Q96M89

CCDC138, Coiled-coil domain-containing protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC138Q96M89 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC138Q96M89 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC138Q96M89 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC138Q96M89 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC138Q96M89 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC138Q96M89 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC138Q96M89 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC138Q96M89 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC138Q96M89 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC138Q96M89 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC138Q96M89 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC138Q96M89 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC138Q96M89 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC138Q96M89 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC138Q96M89 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC138Q96M89 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCDC138Q96M89 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC138Q96M89 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC138Q96M89 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC138Q96M89 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC138Q96M89 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC138Q96M89 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC138Q96M89 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC138Q96M89 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC138Q96M89 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC138Q96M89 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC138Q96M89 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC138Q96M89 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC138Q96M89 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC138Q96M89 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC138Q96M89 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC138Q96M89 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC138Q96M89 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC138Q96M89 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC138Q96M89 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC138Q96M89 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC138Q96M89 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC138Q96M89 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC138Q96M89 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC138Q96M89 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC138Q96M89 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC138Q96M89 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC138Q96M89 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC138Q96M89 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC138Q96M89 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC138Q96M89 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC138Q96M89 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC138Q96M89 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC138Q96M89 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC138Q96M89 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC138Q96M89 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC138Q96M89 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC138Q96M89 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC138Q96M89 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC138Q96M89 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC138Q96M89 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC138Q96M89 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC138Q96M89 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC138Q96M89 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms