Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms