Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CNBD2Q96M20 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CNBD2Q96M20 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms